Charlie Heller (Malek), et geni og en svært introvert dekoder, jobber for CIA fra et kjellerkontor ved hovedkvarteret i Langley. Hans liv blir fullstendig snudd på hodet da hans kone blir drept i et terrorangrep. Men siden hans overordnede ikke iverksetter tiltak, velger han å ta saken i egne hender. Han legger ut på en farlig tur over hele verden for å finne de som er ansvarlige med sin intelligens som sitt sterkeste våpen.